PyMOL - Download

الاشياء الجيدة

نظام التلوين هو المكان الذي يتألق فيه PyMOL حقًا. يمكنك تسليط الضوء على بقايا محددة - على سبيل المثال، جميع الهستيدينات الموجودة في الموقع التحفيزي - بأمر واحد. لقد استخدمت خيار اللون "حسب السلسلة" لفصل الوحدات الفرعية في المجمع، وفجأة لم يعد الهيكل مجرد نقطة بعد الآن. لقد نقرت. وأدوات القياس؟ فائقة الدقة. لقد قمت بالتحقق مرة أخرى من أطوال السندات وزواياها مقابل القيم المنشورة، وكانت مطابقة تمامًا. كما أن البرمجة النصية باستخدام لغة بايثون ستغير قواعد اللعبة. لقد كتبت نصًا سريعًا لإنشاء مناظر جانبية للبروتين من زوايا مختلفة تلقائيًا، مما وفر لي ساعات. تدعم خيارات التصدير PNG، وPDF، وحتى الرسوم المتحركة، بحيث يمكنك إسقاطها في شرائح أو تقارير دون متاعب.

غير جيد

حسنًا، لنكن واقعيين، الواجهة... مخيفة في البداية. عندما تفتحه، تشعر وكأنك دخلت إلى مختبر شخص ما دون معطف المختبر. لا إمساك باليد. لكن بصراحة، بمجرد أن تتجول لمدة 15 دقيقة، يصبح الأمر منطقيًا. ومع ذلك، قد يضيع المبتدئون ما لم يتبعوا البرنامج التعليمي. لا توجد قائمة تعليمات مضمنة تكون مفيدة بالفعل، فقط روابط للمستندات التي تفترض أنك تعرف بالفعل ما هو التمثيل "الكرتون". وعلى الرغم من كونه مجانيًا، إلا أن منحنى التعلم يعني أنه ليس مناسبًا للاستخدام غير الرسمي. إذا كنت تتطلع فقط إلى عرض الجزيء مرة واحدة ثم المضي قدمًا، فقد يكون ArgusLab (وهو مجاني أيضًا) أكثر سهولة. بالإضافة إلى ذلك، فهو ليس مُحسّنًا لشاشات اللمس أو الأجهزة المنخفضة الجودة، فقد تعثر جهاز الكمبيوتر المحمول القديم الخاص بي أثناء العرض الثقيل.

خلاصة القول

إذا كنت تعمل في مجال التعليم أو البحث أو دراسة البيولوجيا الجزيئية، فإن برنامج PyMOL - تنزيل لنظام التشغيل Windows يستحق الاقتناء بالتأكيد. إنه مجاني، ومليء بالأدوات التي تتقاضاها معظم التطبيقات، وجودة الإخراج من الدرجة الأولى. فقط توقع قضاء بعض الوقت في اكتشاف ذلك. بالنسبة لأي شخص يقوم بعمل جاد مع البروتينات أو الجزيئات الصغيرة، فهي واحدة من أفضل الأدوات المجانية المتاحة. قم بتخطيها فقط إذا كنت تتصفح فقط أو تحتاج إلى شيء بسيط للغاية. خلاف ذلك؟ المضي قدما وتنزيله. سوف تشكر نفسك لاحقا.